服药前必须认真阅读药物说明，明确会产生的副作用。总的来说，大部分药物副作用发生率都很低。如果吃药开始或者调整剂量的时候有明显不适症状产生，那这些有可能是药物所引起的。患者吃两种或两种以上的抗癫痫药物应更加仔细的观察是否出现不适症状。
1、神经系统
造成大脑出现的一些不良反应包括嗜睡、疲惫或感觉眩晕。患者可能出现平衡及复视等问题。一些确定的癫痫药物如拉莫三嗪和非尔氨酯制剂可能会引起睡眠问题。患者认知上出现的问题有可能是药物引起的，也有可能是癫痫放电活跃或者发作造成。药物有可能造成兴奋性及情绪的改变。镇静安眠剂可能会造成认知问题，学习困难，过度兴奋，易怒，特别是在儿童中。开浦兰可能引起习惯上改变。拉莫三嗪可能引起过度焦虑、头疼或者失眠。一些老的抗癫痫药物（妥泰）可能引起神经上的疾病，如手和脚部针刺感。
2、皮肤及粘膜
抗癫痫药物可能会引起皮肤以及口腔黏膜的一些改变。例如苯妥英钠可能造成牙龈出血、牙龈增生、毛发变密及皮肤粗糙。丙戊酸钠可能会造成毛发脱落。这些副作用对于女性来说都比较难以接受。除此之外，药物（拉莫三嗪）过敏性反应要尤为关注，当出现皮疹等过敏反应立即联系医生。严重的话可能需要去皮肤科就诊。
3、骨骼
一些老的抗癫痫药物会引起严重的骨质疏松。骨密度检查提示骨质疏松建议立即换药。骨质疏松容易导致脊柱或髋骨折。
4、性激素
在女性患者中，一些特定药物会影响生理周期，降低口服避孕药的作用，增加受孕难度以及会改变排卵周期。还可能引起多囊卵巢的改变。患者出现这些症状后应进行检查（激素及卵巢B超）。对于男性抗癫痫药物可能会造成睾丸激素水平下降。
5、体重改变
丙戊酸钠、加巴喷丁及得理多可能会引起体重增加。
妥泰、唑尼沙胺、非尔氨酯制剂或生酮饮食会使体重下降。
6、肾脏
妥泰、唑尼沙胺或生酮饮食有可能造成肾结石的改变，但这种情况比较少见。如果有肾结石家族史或者联合服用其他的一些药物会增加这种副作用的风险。一些药物主要通过肾脏排泄，如开浦兰和加巴喷丁。所有抗癫痫药对于肾功能障碍患者都需要调整。
7、肝脏
使用抗癫痫药物的患者常显示肝脏一些酶的轻微升高。如果酶水平高于正常值三倍以上必须引起重视，这时当选择其他的抗癫痫药物。肝衰竭是非常罕见的特异副作用。丙戊酸钠禁用于两岁以下儿童，因为他们的肝脏未发育成熟。
8、血液化学改变
再生障碍性贫血是抗癫痫药物的罕见并发症，这可能致命，因为骨髓抑制所有红、白细胞和血小板的生成。更常见的是低钠、低白细胞、低血小板计数，和轻微肝酶学升高。大多数抗癫痫药物可降低甲状腺的激素的水平。对于一些患者来说副作用也可能产生正向作用。偏头痛、精神障碍、焦虑或抑郁在遭受癫痫折磨的患者身上都是常见的。丙戊酸钠和妥泰被证实对偏头痛有效。拉莫三嗪、得理多和丙戊酸钠可作为情绪稳定剂，并对双相障碍或精神障碍有效。
