粤港澳大湾区医药高端标杆产业园位于广东大旺国家级高新技术开发区，地处珠三角中心区西部、肇庆市最东端，与佛山市三水区一河之隔。“向东”基本融入大湾区“1小时交通圈”，“向西”已形成4小时内通达周边5个省会城市的高铁交通网，现已逐步拥有集“空、铁、水、公”于一体的立体黄金交通网络。

公路

南与321国道相连，北与107国道相通，二广高速、广肇佛高速、珠三角外环高速分别从园内的南部、中部和北部经过。

铁路

广茂铁路、贵广高铁、南广高铁以东西向自园区南侧穿过。广茂铁路是连接珠三角与粤西地区的交通干线，向东可直达广州、进而与京广线乃至全国铁路网相连，往西可到达茂名、湛江与广西铁路网相接。贵广高铁、南广高铁分别连接广州和贵阳、南宁，是广东连接大西南地区的交通大动脉。