从中医的角度看来，无论是新冠肺炎还是流感，都属于外感热病，是瘟疫的一种。其发病特点是能在人群间互相传染，患者的病症大致相似，大都存在发热、咽痛、黏痰不能顺畅咳出等。对于瘟疫的防治，中医药已经形成了一整套系统且独特的理论和实践体系。

连花清瘟胶囊/颗粒组方吸取了历代医家治疗疫证的用药精华，以汉代张仲景《伤寒论》中的麻杏石甘汤与清代吴鞠通《温病条辨》中的银翘散化裁，汲取明代吴又可《温疫论》治疫证用大黄经验。麻杏石甘汤，宣肺泄热、止咳平喘；银翘散，清瘟解毒、辛凉宣肺，两个药方针对疫病发热咳嗽、喘促气短用药。现代药理研究发现，两个药方都具有良好的退热、止咳、抗炎、抗病毒作用。辛凉宣肺与泄热，可以解决新冠肺炎患者持续发热的问题；清肺止咳平喘，可以改善新冠肺炎患者的咳嗽不止，呼吸困难；抗炎抗病毒作用可以抑制新型冠状病毒的复制，抑制病毒感染引起的系统性炎症反应。

除应用麻杏石甘汤与银翘散之外，连花清瘟还具有三大用药特点，首先采用大黄通腑泄肺，肺与大肠相表里，其通便泄下之力使肺部火热之邪从大便排出，而肺部炎症得以解除；使用大黄另一价值是先证用药，截断病势。现代药效研究证实大黄具有抑制肺部炎症，改善肺功能作用。

第二，运用藿香芳香化湿、避秽化浊。新冠肺炎有一个突出特点，就是湿邪浊毒偏重，病人表现为食欲差，大便粘滞不爽，藿香正可以避秽化浊，改善食欲不振、湿困脾胃的状况。

第三，连花清瘟中还有关键的一味药是红景天，它生长在高寒、高海拔地区，具有补肺平喘活血作用，可以提高人体抗疲劳、耐缺氧能力，提高机体的抗病康复能力。