然而，近年来，修正在产品质量问题频出、网贷风波、用高额股票贿赂官员等问题，广受诟病。

首先是与品牌知名度不相符的产品质量，2012年4月，毒胶囊事件让修正名誉扫地，羚羊感冒药胶囊、斯达舒等陷入“毒胶囊事件”旋涡，修正药业被检出铬含量超标，涉嫌非法添加工业明胶。如今“毒胶囊”事件虽然已经过去了7年，但是并未让修正药业的质量问题就此得以修正，从各级监管部门公布的药品质量黑榜来看，修正药业一度是榜单上的常客。

其次是2018年，修正药业投资多个互联网借贷P2P平台“爆雷”，修正也因此深陷网贷风波。据健康时报报道，2018年9月5日上海市公安局发布的一则通告。通告称，上海市公安机关通过国际执法合作，成功将“永利宝”、“火理财”平台涉嫌非法吸收公众存款罪的6名主要犯罪嫌疑人抓捕归案。“永利宝”、“火理财”均为互联网借贷信息中介平台，而它们被爆都与修正董事长修涞贵及其名下子公司有关联。

并且于2017年7月，修正药业爆出行贿官员丑闻。吉林省长白朝鲜族自治县原县委书记褚来福受贿罪的判决，牵出了修正药业多年前的行贿细节，修正药业集团董事长修涞贵将通化市制药股份有限公司的25万股股权授予给了褚来福，价值人民币25万元。