第二天，美国食品与药品设计局(FDA)发出劝诫，两名患者移植未经抗药细菌查验的粪便后激发很有问题传染，并组成一人入世。今朝，一系列关系的病例履行被叫停，直到钻研者们可以证实他们已订定峻厉流程，筛掉含有无害微生物的布施粪便。

据认识，粪菌移植是将安康帮手者粪便中的屈从菌群经由未必方法移植到患者肠道内，重修肠道微生物稳态，调理肠道菌群的平衡，从而弘扬治疗肠道菌群均衡疾病的感导。

在上述FDA通报的病例中，问题出在搜集粪便的流程上，这名捐粪者的粪便并不有发展相应的菌群检测，而在很有问题的感染标题孕育发生以后，医疗机构转头检测了这位捐粪者的粪便，创造正是来自其粪便的多重耐药菌招致了两名患者的污染与十分很有问题的下场。

6月13日，FDA向研讨者收回警告，理应对粪便移植研究中的供体粪便进行耐药性微生物筛查，如果存在这些微生物则不予以使用。

FDA同时郑重告知患者，这一医治手段可能存在风险，目前还未失去允许，并且仅应在困难梭菌感染，标准治疗有效时，仅作为末端的本事使用。

FDA生物制指摘估和钻研焦点主任Marks博士体现，只管我们赞成粪菌移植这一范围应用于病例医治疾病的科学发明，但值得把稳的是，粪菌移植并非探囊取物不有风险。因而，仍需暗示钻研规模的医护人员，对粪菌移植的平安性牢靠性高度重视，抗御一些荫蔽风险的发生发火。

频年来，粪菌移植目前被越来越多用于治疗老火的肠道疾病，分外是困难梭菌惹起的净化。

截止2017岁终，环球已有约40000例次粪菌移植治疗，首要由美国Openbiome、澳大利亚悉尼消化外围、南京医科大学第二从属医院肠病焦点库实现。