《国家科学评论》发表的论文《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》发现新冠病毒SARS-CoV-2毒株已发生突变，且多是近期产生的。
论文通过对103个新冠病毒全基因组分子的进化分析发现，新冠病毒已演化出L和S两个亚型，发生了149个突变点。
论文截图
S亚型与来自蝙蝠的冠状病毒更接近，更古老，攻击性也更弱，占比更低，约为30％。
L亚型的侵略性、传染性更强，占比也更高，约70％。在武汉疫情爆发初期，L亚型病毒更为普遍，但恰恰因为其侵略性、传染性强，L亚型病毒被人为压制得更厉害，使其在今年1月初之后有所减少。
假如不是突变后的L亚型新冠病毒如此猖獗，我们也许现在都没发现新冠肺炎的可怕。但对于病毒突变，人类也不必谈之色变，突变对病毒来说实在太正常。特别是RNA病毒，简直就是为变而生。
变中求生的RNA病毒
与我们不同，病毒喜欢变异，特别是RNA病毒。
人体细胞中有一种酶，专门负责对复制中的DNA纠错，来保障基因的稳定性。即使这样，人类还是有发生基因突变的情况。
病毒作为只有蛋白质外壳和里面包裹着的核酸（DNA或RNA）组成的简单“生物”，没有专门修复DNA错误的酶，就容易发生突变。
RNA病毒善打''闪电战''，迅速在宿主体内复制大量（高浓度）病毒，使宿主因急性感染打喷嚏、咳嗽、呕吐、流血、腹泻泄出病毒，感染其他受害者，并在宿主的防御系统能击退它们之前''跑路''，然后销声匿迹。
由于基因突变率极高，且变幻无常，RNA病毒的自我繁殖的能力有限，一旦超过这个限制，病毒自己就会因变异率出现太多错误使得自己停止自我复制，这就是艾根悖论。受艾根悖论的束缚，RNA病毒只能通过制造大量的病毒变种来弥补它们的错误、单一性和不稳定性，从而实现及早传播和频繁传播的目的。
也正是由于复制错误和基因不稳定，RNA病毒可以产生很多变种。多数情况下，病毒的''72变''纯属瞎折腾，其变异效果就如同人类多长颗牙齿或手指那样，对战斗力毫无帮助。有些病毒的变异，就像人类的基因突变疾病一样糟心，历史上有些疫情的消失都是靠病毒的变异自我毁灭。也有极少的一小撮病毒，会获得如同开挂的''超能力''使它们迅速进化，就像L亚型的新冠病毒，侵略性、传染性俱佳，一下子被人类盯上，给予重点打击。
与人类''厮杀''过的病毒也会逐渐收敛，病毒不是敢死队，它们和人类一样有一个繁荣昌盛的愿望。病毒四大生存挑战：
1.怎样转移到下一个宿主
2.怎样进入宿主细胞
3.怎样利用宿主细胞实现自我复制
4.怎样脱离宿主细胞和宿主
当它们适应了人类后，也会逐渐变得''温柔''，并期望与人类实现长期共存。
病毒之所以''善变''，也是为了更好的''融入我们''。说到融入，只能在人与人之间横向传播的新冠病毒还差得远。那些会垂直传播的病毒才是真正融入我们生命的病毒。
融入生命的内源性逆转录病毒
比起在人与人间横向传播的病毒，垂直传播的逆转录病毒能把自己刻录到宿主的DNA里，让宿主“自觉”为自己世代传播病毒。
这不就是母婴传播吗？垂直传播比母婴传播强悍，父婴传播也行得通。下面我们就通过鸡看看垂直传播的病毒。
20世纪60年代，科学家对一种致癌病毒进行了深入的研究，这种病毒叫禽白血病病毒的逆转录病毒。
和普通病毒一样，逆转录病毒也在趁宿主细胞分裂时生产新病毒，但逆转录病毒还有种“超能力”，能在自己插入细胞的位置合成蛋白质，当逆转录病毒在身体里乱跑，并插错地方，并合成蛋白质时，这个地方就会形成肿瘤，还可能导致癌变。
令科学家们困扰的是，在从未与病毒接触的健康鸡血液中，也能找到禽白血病病毒的蛋白质。这种携带病毒蛋白质的健康母鸡生下的小鸡很健康，但还是携带这种蛋白质。
这些病毒蛋白从哪里冒出来的？
病毒学家罗宾·韦斯（Robin Weiss）猜测，禽白血病病毒可能通过变异，转化成无害的组成部分并嵌入了鸡的遗传基因，所以健康的鸡也会携带病毒蛋白。他从健康鸡身上取了一些细胞，用能引发突变的化学物质和辐照来处理这些细胞后，突变的细胞果然又释放出了禽白血病病毒。
因为这种病毒不是通过外界感染，而是由生物内部产生，所以科学家称其为——内源性逆转录病毒。
突变让逆转录病毒把自己嵌入宿主的遗传基因，之后宿主身上每颗细胞都带着病毒的遗传信息。这种传播方式，比自己拼命找宿主、找突破口、找自我复制方式、找脱离途径的新冠病毒轻松多了，还不用被宿主的免疫系统追杀。
哪天受点“刺激”再突变一次，人家又是最致命的病毒，这也是健康个体罹患癌症的方式之一。
那人类身上有没有内源性逆转录病毒？别担心人身上不止有，而且数量惊人。
早在数千万年前内源性逆转录病毒就入侵了灵长类祖先的基因组，经过数百万年的演化，现在平均每个人的基因组中携带了近10万个内源性逆转录病毒的DNA片段，占到人类DNA总量的8%（人类基因组中负责蛋白质编码的基因，才占总量的1.2%）。
不管人类想不想，病毒已经与我们共存很久了，人类本身就是行走的病毒博物馆 。
现在科技如此发达，我们能不能去掉这些该死的病毒基因？能！但劝你不要这样做，因为没有病毒人类连活着出生都做不到。
没有病毒的人类会是什么样子
经历过疫情的人们总会觉得，人类与病毒是你死我活的仇敌关系，即便病毒通过变异找到与人类和谐共处的途径，人类的内心也是拒绝的。但从基因上看，人类早就与无数病毒融合过了。
我们每个人就接受过病毒的帮助。
每个人出生前，都是通过胎盘从妈妈体内获取营养的，而胎盘就是靠病毒输送营养的。
1999年，让—吕克·布隆（Jean-Luc Blond）发现了一种名为合胞素（syncytin）的蛋白质。这种蛋白质只出现在胎盘里，能让细胞黏着在一起。并让分子在细胞之间顺畅地流通。这个蛋白质就是由一种名为HERV-W的人类内源性逆转录病毒合成的。
憎恨病毒基因的人当然可以删除这段基因，科学家就做过类似试验，他们删除了小鼠的合胞素基因，结果小鼠的胚胎没有一个能活到生出来。没有合胞素蛋白的帮助，胚胎就无法从母亲体内吸收营养。
我们身体里有些病毒基因确实是健康隐患，但它们存在的正面价值更高，只是我们还没有全面了解。就像现代城市的道路，可能因为车祸等意外带来危险，但没有人因为害怕这种危险而放弃使用道路，因为它太便利。更不会有人因害怕车祸，每天郁郁寡欢，这不值得。
无论我们精神上愿不愿意，肉体早与病毒你中有我，密不可分。没有病毒，人类甚至不会变成现在的样子。
病毒不是生病的橡皮擦，它更像生命基因的工程师。人类的基因能如此出众，正是由于病毒这个“工程师”近亿年的修改，变异也许就是这位基因工程师的灵感。
