《科学》：肿瘤细胞的表观遗传学图谱

图片来源：V. Altounian/Science

肿瘤是世界上导致死亡的首要原因之一。目前，科研人员对只占人类基因组2%的编码蛋白的基因有深入的研究，但是对非编码基因组部分和肿瘤中的基因调控的研究仍然很少。癌症基因组图谱（TCGA）是一个致力于加快对癌症分子基础的研究的组织。它系统性地收集了大量与人类癌症组织相关的DNA突变，甲基化，RNA表达和其它分子生物学信息。斯坦福大学的研究人员利用对TCGA中410个癌症样本的测序构建了癌症染色质可及性的图谱。这一图谱可以描绘出从表观遗传学水平上对基因表达的调控。通过将这一信息与同一肿瘤样本的其它组学信息相比较，研究人员发现众多与癌症发病风险和患者生存相关的突变信息。这些DNA序列的变异虽然不影响蛋白的功能，但是对癌症的临床预后有重要影响。

相关论文：Corces, et al., (2018). The chromatin accessibility landscape of primary human cancers Science, https://doi.org/10.1126/science.aav1898

《Science Translational Medicine》：治疗髓母细胞瘤的新药物

髓母细胞瘤是小儿中较常见的颅内肿瘤，它是中枢神经系统恶性程度最高的肿瘤之一。髓母细胞瘤的group 3和group 4亚型异质性非常强，导致它们很难被靶向治疗，因此患者生存率很低。休斯顿卫理公会研究所和癌症中心的研究人员利用系统生物学的方法发现一种已经获得批准的药物可以治疗这类癌症亚型。在小鼠肿瘤模型中使用这种称为地高辛（digoxin）的药物可以延长小鼠生存期，而且将它与放疗联合使用可以得到更好的效果。这项研究可能为这一难治性癌症患者提供新的治疗方法。

相关论文：Huang, et al., (2018). Systems biology–based drug repositioning identifies digoxin as a potential therapy for groups 3 and 4 medulloblastoma, https://doi.org/10.1126/scitranslmed.aat0150

《Science Signaling》：调控眼皮形态发育的机制

图片来源：Bian et al./Science Signaling

在很多哺乳动物中，为了防止眼睛在出生时或出生后的早期发育过程中不受损伤，眼皮会完全盖住角膜并且融合在一起。但是调控这一发育过程的机制还未得到澄清。西安第四军医大学的研究人员使用小鼠遗传模型和体外组织培养实验，证明一种称为鞘氨醇1-磷酸（S1P）的脂类能够促进眼皮融合。它通过刺激表皮生长因子受体的信号通路，激活影响细胞迁移的蛋白。这项研究揭示了调控细胞迁移和眼皮融合的复杂信号通路。

相关论文：Bian et al., (2018Sphingosine 1-phosphate stimulates eyelid closure in the developing rat by stimulating EGFR signaling, https://doi.org/10.1126/scisignal.aat1470

《自然》：婴儿的肠道菌群生长与糖尿病的关系

图片来源：Alberto Seveso

婴儿在出生之后肠道菌群的生长被认为和诸如1型糖尿病等疾病的病理发生有关。但是，我们对婴儿在出生后肠道菌群的生长并不十分了解。本期《自然》发表的两篇论文对婴儿的肠道菌群在出生后的发育和1型糖尿病婴儿的肠道菌群的特征进行了研究。研究结果表明，母乳对婴儿在出生后早期的肠道菌群生长有很重要的影响。而将健康婴儿的肠道菌群与1型糖尿病婴儿的肠道菌群进行比较，研究人员发现健康婴儿的肠道菌群中包含更多与短链脂肪酸的合成和发酵相关的基因。这一发现意味着短链脂肪酸可能有预防1型糖尿病的作用。