国务院于1966年1月7日以（66）国文办字第3号文件批准成立中国医疗器械工业公司，新中国第一家国家级医疗器械公司诞生。此后，在中国医疗器械工业公司归口管理下，全国有20个省、自治区、直辖市设立了医疗器械公司，实行行业管理，我国医疗器械工业管理翻开了新的一页。

    中国医疗器械工业公司成立后，加大了对全国医疗器械老企业的改造力度。1966年~1978年，该公司先后对山东新华医疗器械厂、北京医用射线机厂等18家老企业进行改造，基建投资拨款3610万元，新增建筑面积14.71万平方米。

    在国家医药管理总局领导下，1979年~1983年又对天津医疗器械厂、青岛医疗电子仪器厂等19家老企业进行扩建或全迁，共投资4928万元，比前13年增加了36.5%，新增建筑面积14.83万平方米。许多老厂通过技术改造，提高了综合生产能力和经济效益，成为行业的中坚力量。

    1968年~1983年，该公司共投资7086万元新建、迁建了分布在14个省市的22家医疗器械公工厂，进一步扩大了工业基础和品种规格，提升了技术水平。

    1974年，该公司制订出全国医疗器械开发新产品和发展生产规划，确定了一批重大科技攻关项目，并组织跨地区、跨行业的协作攻关，一批重大科研项目获得成功。

    为提高产品质量，该公司陆续制定出“产品质量管理”、“产品质量考核”、“产品质量分等细则”等一系列规定，在行业内推行全面质量管理和“生产许可证”制度。

    1982年，该公司对厂点布局和产品结构进行调整，使供过于求的产品明显减少，商业部门库存明显趋向合理，基本扭转了多年来产销比例失调的状况。

    为改变医疗器械公行业供需矛盾、工商矛盾、渠道不畅等问题，该公司提出以销售带动生产的行业发展思路，并于1979年7月12日在北京成功举办首届全国医疗器械展销会，行业产品分配方式开始由计划经济模式向市场经济模式转变。

    1985年，全国医疗器械工业出现了总产值比上年增长23%、利润增长13.7%的可喜局面。最近20多年来，我国医疗器械工业实现高速发展，2008年实现生产总值2200亿元，工业销售收入2100亿元，利润超过200亿元。

    1999年11月8日，国家实施政企分开，中国医疗器械公工业公司和中国医药工业公司、中国医药公司、中国医药对外贸易公司一起，组建中国医药集团，现为该集团全资子公司。