医药企业在最近几年来一直是财政部、税务机关稽查的重点。从2016年开始，医药企业每年都出现在国家税务总局公布的重点稽查名单内。每年公布的虚开大案、要案名单里，医药企业一直位居前列。

今年开始，财政部又选取77 户医药企业开展会计信息质量检查，对医药销售环节开展“穿透式”监管，延伸检查关联方企业和相关销售、代理、广告、咨询等机构，必要时可延伸检查医疗机构。

现阶段医药行业税务合规存在的问题

一、医药生产企业接受虚开的增值税发票（包括专用发票和普通发票）

长期以来，医药行业内盛行带金销售。据不完全统计，医药代表通过“走票”等形式套取现金转给医生的费用高达40%。药品零售价的70%-90%流向中间环节和医院终端。在此情形下，为了提款，明知没有真实交易，医药企业接受各种名目虚开的增值税发票，来实现洗白“不能见光的钱”的目的。

二、医药销售企业CSO(Contract Sales Organization)虚开增值税发票

CSO企业的存在，本意在于促进医药行业销售业务的进一步专业化发展。但是，在实际中很多情况下，CSO企业成为一个虚开增值税发票的“过票”、“倒票”公司。

究其原因，在于医药生产企业旺盛的发票需求，在巨大的利益诱惑下，很多CSO企业以咨询费、会议费、广告费的名义，开具了大量增值税发票。

这些CSO企业一般设立在税收洼地或有财政返还的地方，使其能够以很低的成本开具高额的发票。

三、中药、中成药医药生产企业的虚开农产品收购发票

中药、中成药医药生产企业，为了生产药品的需要，必须向农户收购中药、草药等，在这一过程中，由收购方医药生产企业直接开具农产品收购发票并予以抵扣。

在实践中，农产品的收购往往地域广、品种杂，现金交易及自然人交易多，税收征管难度大。因此，部分企业也打起了农产品收购发票的主意，大肆虚开农产品收购发票。

医药行业税务合规监管的现状

一、营改增

2016年5月开始，“营改增”在全国所有行业全面推开，所有营业税征税项目改征增值税。增值税实现了全覆盖，不再存在增值税的死角。

这意味着全国所有企业的各类交易行为，都成为增值税监控下的行为。所有的增值税发票，不论是普通发票还是专用发票，均从全国即时联系的增值税发票开票系统开具，并严格要求发票信息与实际交易情况完全一致。

二、两票制

从2018年开始，国家在全国药品生产流通领域推行“两票制”。

两票制，是指从药品出厂到进入医疗机构（即医院），只能开具两次发票。其中，第一次开具发票为生产企业向流通企业（医药经销商）开具发票，第二次开具发票为流通企业向医疗机构开具的发票。

两票制改变了以往从药品生产到医疗机构要经过7、8次开票流通的情况，有力地打击了医药行业盛行的通过层层经销、分销、代理等形式进行的洗钱、贿赂行为，压缩药品流通环节，降低医院实际药价，净化经营环境。

三、金税三期

金税三期系统的全面完善和增值税发票开具系统的上线，使税务机关能够360度全方位无死角的监控企业行为，以往各种粗放的税务违法行为将无处遁形。

税收违法的法律后果

一、行政法律后果

1、补税+滞纳金（按日加收0.5‰）+罚款（0.5-5倍）

根据《中华人民共和国税收征管法》的规定，对企业以各种形式的偷税，税务机关有权追缴其不缴或少缴的税款及滞纳金，并加收不缴或少缴税款金额0.5-5倍的罚款。

2、税收违法黑名单

根据国家税务总局《重大税收违法案件信息公布办法》和《关于对重大税收违法案件当事人实施联合惩戒措施的合作备忘录》的规定，对严重的涉税违法行为，税务机关将向社会公布税收违法黑名单，其中就包括“虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，以及虚开普通发票100份或者金额40万元以上的”。

同时，税务机关还对严重涉税违法行为实行联合惩戒制度，即阻止出境，任职限制，融资参考，限制高消费，限制、甚至禁止多项经营行为，多部门从严监管等等。可谓“一次违法，寸步难行”。

二、刑事违法后果

医药企业的税收违法行为还会涉及到严重的刑事违法后果。

1、刑法第205条 【虚开增值税专用发票罪】

刑法第205条规定虚开增值税专用发票是指没有货物购销或者没有提供或接受应税劳务而为他人、为自己、让他人为自己、介绍他人开具专用发票；有货物购销或提供或接受了应税劳务而开具数量或金额不实的专用发票；进行了实际经营活动，但让他人为自己代开专用发票。

根据最高人民法院印发的《关于虚开增值税专用发票定罪量刑标准有关问题的通知》〔法（2018）226号〕：虚开的税款数额在五万元以上的，以虚开增值税专用发票罪处三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；虚开的税款数额在五十万元以上的，认定为刑法第二百零五条规定的“数额较大”，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金;虚开的税款数额在二百五十万元以上的，认定为刑法第二百零五条规定的“数额巨大”，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。

2、刑法第205条之一【虚开发票罪】

虚开增值税普通发票，会涉及到刑法第205条之一的【虚开发票罪】。刑法规定，虚开本法第二百零五条规定以外的其他发票，情节严重的，处二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金;情节特别严重的，处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。

根据《关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）的补充规定》，存在以下行为公安机关即需要立案：

（一）虚开发票一百份以上或者虚开金额累计在四十万元以上的；

（二）虽未达到上述数额标准，但五年内因虚开发票行为受过行政处罚二次以上，又虚开发票的；

（三）其他情节严重的情形。”

医药企业的合规措施

在此大环境下，医药企业如果要健康有序的发展，必须将税法合规放在重中之重。

应重心前移，做好预防。即税务合规的重点不应放在税务稽查甚至公安机关侦查后的补救上。真正有效的预防，应重心前移，在稽查或经侦介入之前，就做好预防工作。应苦练内功，规范管理。即企业内应建立健全完整的财政制度，不给“黑色”、“灰色”行为可乘之机。

同时可以引入专业机构协助。即在律师事务所、会计师事务所等专业机构的协助下，更好更快的解决问题。