2019年上半年，上海医药商誉为114.84亿元，2018年末为113.45亿元，增幅1.22%。上海医药表示，本年度增加的商誉主要系购买重庆上药慧远药业有限公司所致。

2019年3月15日，上海医药发布了关于计提商誉减值准备的公告，拟对公司收购的Vitaco、星泉环球有限公司及台州上药医药有限公司所形成的商誉计提减值准备6.32亿元，本次计提将减少上海医药2018年度合并报表归母净利润约4.87亿元。

2019年上半年，上海医药资产总计1339.14亿元，2018年末为1268.79亿元，增长5.54%。其中，流动资产为979.27亿元，非流动资产为359.87亿元。