段富津在传承、弘扬中医的基础上，提出用中西医结合的研究思路研究方剂学，即运用现代的实验研究思路和先进的实验研究手段及方法，开展方剂学基础研究。

从医、执教六七十年，段富津先后出版《金匮要略方义》等学术著作20余部，发表高水平学术论文40余篇。其中《金匮要略方义》是我国历史上第一部全面剖析《金匮要略》全部方剂的理论专著，尤其在古方今用与方剂配伍规律方面的诸多论点得到了同行专家的赞誉。

段富津主持承担国家级科研课题4项、省部级课题6项、厅局级课题8项，获国家级教学成果一等奖1项，省科技进步奖7项，其他奖励多项。20世纪90年代，他以超前思维，在全国中医药院校方剂学学科中第一个成立方剂实验室，率先开展实验方剂学研究。1994年，段富津被评为黑龙江省名老中医，2014年被评为国医大师。